1958年7月，为加快安徽建设，改变皖北地区人民群众缺医少药的局面，国家决定由原上海第二医学院（现上海交通大学医学院）以及安徽医学院（现安徽医科大学）援建创立蚌埠医学院。2023年11月，经教育部批准，学校更名为蚌埠医科大学。

67年的办学历程中，一代代蚌医人将“博极医源，精勤不倦”的“上二医精神”薪火相传、励精图治，培养出以5名院士为代表的一大批杰出医学人才。

中国工程院院士：刘德培、范先群

中国科学院院士：段树民、陈孝平、王福生

学校是国家首批具有学士和硕士学位授予权单位，教育部硕士研究生推免高校，国家首批卓越医师教育培养计划试点高校，全国首批专科医师规范化培训基地，国家级大学生创新创业训练计划实施高校和国家级大学生校外实践教育基地；是安徽省博士学位授予立项建设单位，安徽省博士后岗位设置单位，陆军军医大学、暨南大学、安徽医科大学博士研究生联合培养单位。

学校坐落于淮河流域重要的交通枢纽城市——蚌埠，濒临千里淮河，承山水涵养之灵气，传杏林济世之流芳,现有龙子湖校区、治淮校区、宏业校区、淮上校区和高铁校区，占地面积1700余亩，是安徽省园林式单位和绿化模范单位，安徽省首届教育系统文明单位和安徽省第十一届文明单位。

学校现有教职医护员工近6600余人（含直属附属医院），专任教师1038人，其中教授188人、副教授369人，硕士生导师1279人、联合培养单位博士生导师56人，具有博士学位的教师459人。学校现有教育部长江学者特聘教授、享受国务院和省政府特殊津贴专家等60余人，全国优秀教师、全国模范教师、省教学名师、教坛新秀等98人，省学术和技术带头人及后备人选、省特支计划、江淮名医等84人，皖江学者4人。学校拥有2所直属附属医院、10所非直属附属医院，承担了皖北地区近3000万人口医疗服务任务，辐射淮河流域和周边省份。

        学校现拥有医学、理学、工学、管理学、教育学等学科门类，30个本科专业，全日制在校本科生12000余名，硕士研究生3100余名（含留学生），有6个一级学科硕士学位授权点和8个硕士专业学位授权类别，临床医学、药理学与毒理学2个学科进入ESI全球排名前1%。学校拥有3个国家级一流本科专业、1个国家级特色专业、1个国家级综合改革试点专业、12个省级特色（一流、品牌）专业、11个省级综合改革试点专业，6个国家临床重点专科、4个省级重点学科、3个省级高校高峰（培育）学科、30个省级重点专科和重点培育专科、2个省级特色专科，4个省级诊疗中心，3个国家级科研平台，2个国家药物临床实验机构，省重点实验室、临床医学研究中心等省级平台11个，省人文社科重点研究基地等教育厅平台5个，1个国家级临床技能综合培训中心，11个省级示范试验实训中心，3个省级虚拟仿真实验教学中心，2个省级及以上人才培养模式创新实验区。