河南省医学科学院为省政府举办的全省综合性医学科研新型研发机构，省政府直属公益性事业单位。

河南省医学科学院以协同创新为主要方式，与中原医学科学城融合发展，形成“一院一城一产业集群”的创新格局和基础研究+临床技术攻关+成果转化+科技金融+人才支撑+产业培育全要素医学科学创新生态，将打造为开放共享的医、教、研、产、资“五位一体”的新型研发机构和公共平台。开展基础研究，建立中原纳米酶实验室、中原细胞和免疫治疗实验室、中原再生医学实验室、中原智能医学实验室；开展临床研究，已建立眼科、生殖健康、电生理、康复医学、智能医学、脑科学、肿瘤、心血管病、儿童医学、感染与免疫、生物治疗等研究所；开展成果转化，成立技术评估评价中心、临床试验发展中心，组建河南省医学科学院控股有限公司；布局建设质子医疗中心、智能医学研究设施、人体泛蛋白修饰组学等医学重大科技基础设施；省人民医院、省肿瘤医院、阜外华中心血管病医院、省胸科医院、省儿童医院等医疗机构为附属医院，郑州大学附属医院、河南大学附属医院、河南科技大学附属医院、新乡医学院附属医院等医疗机构为合作医院；聚集高层次创新型青年人才，建立研究生院，设立博士后科研工作站，组建豫健医学发展基金会等机构。