昆山市中医医院于1985年1月独立建院，2019年获批成立江苏省中医临床研究院昆山分院，是一家集医疗、教学、科研、康复、预防、保健为一体的现代化三级甲等中医医院。2022年11月26日，医院新址西部医疗中心投入运行，新址建筑面积31.5万平方米，设计床位2000张。整体建筑借鉴江南园林设计理念，为患者提供“智能、高效、方便、快捷、温馨”的医疗服务。院内设有全国首台（套）小型质子治疗设备，在县域内率先开展肿瘤质子治疗，推动高端医疗服务与高端医疗装备联动发展。

目前，医院在岗职工1923人，其中高级职称523名，硕、博士研究生379名，其中博士31名，硕、博士生导师22名。拥有全国首批五百名老中医药专家郑绍先学术经验继承人3名、江苏省名中医2名、江苏省中医药领军人才1名、国家中医药管理局中医药外向型优秀骨干人才1名、江苏省“333工程”第三层次培养对象4名、江苏省“六大高峰人才”1名、江苏省中医临床优秀人才1名。