昆明市中医医院始建于1956年，是一所集医疗、教学、科研、防保、康复、社区医疗等综合服务能力为一体的“三级甲等中医医院”、云南中医药大学第三附属医院、云南省中医名院、国家中医药管理局中医药优势学科（中医外科肛肠病学）继续教育基地、国家中医药管理局社区中医药知识与技能培训示范基地，国家中医药管理局农村中医药知识与技能培训示范基地，国家中医全科规培重点专业基地，国家中医住院医师规范化培训基地，云南省中医药骨干医师培训基地，昆明市中医药制剂中心。医院现有三个执业点（东风东路院区、关上院区、呈贡院区)，总占地面积：160亩，总建筑面积：16.5万平方米，实际开放床位1387张。

    医院一直把中医特色专科专病建设作为事业发展的主线来抓，逐渐形成一批优势学科，现拥有国家、省、市级重点专科专病46个，云南省临床医学中心3个（云南省中医骨伤临床医学中心、云南省中医肛肠临床医学中心、云南省中医针灸临床医学中心），云南省区域中医专科诊疗中心3个（云南省骨伤区域中医专科诊疗中心、云南省肛肠区域中医专科诊疗中心、云南省肺病区域中医专科诊疗中心），云南省中医质量控制中心2个（云南省中医骨伤质量控制中心、云南省中医肛肠质量控制中心），云南省中医药临床重点学科2个（中医骨伤学、中医肺病学），昆明市医学重点学科8个，昆明市医疗质量控制中心4个。省级内设研究中心3个，市级内设研究机构（研究中心、技术中心）27个，昆明市科技创新团队4个。